Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf54Q08AI8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms