Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DSC1Q08554 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DSC1Q08554 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms