Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms