Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNB2Q08289 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms