Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALD1Q05682 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms