Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUCB1Q02818 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms