Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MC1RQ01726 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms