Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

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Length 54 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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