Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1BQ00975 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms