Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK6Q00534 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms