Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB1P82279 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB1P82279 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB1P82279 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB1P82279 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB1P82279 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB1P82279 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB1P82279 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB1P82279 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB1P82279 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRB1P82279 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRB1P82279 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CRB1P82279 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CRB1P82279 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRB1P82279 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRB1P82279 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRB1P82279 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRB1P82279 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRB1P82279 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRB1P82279 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRB1P82279 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRB1P82279 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRB1P82279 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRB1P82279 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRB1P82279 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRB1P82279 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRB1P82279 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRB1P82279 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRB1P82279 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRB1P82279 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB1P82279 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB1P82279 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB1P82279 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB1P82279 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB1P82279 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB1P82279 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB1P82279 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB1P82279 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB1P82279 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB1P82279 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB1P82279 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRB1P82279 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRB1P82279 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms