Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB1AP62820 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms