Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCS1P62166 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCS1P62166 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NCS1P62166 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NCS1P62166 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NCS1P62166 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCS1P62166 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCS1P62166 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCS1P62166 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms