Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VBP1P61758 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VBP1P61758 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VBP1P61758 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VBP1P61758 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VBP1P61758 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VBP1P61758 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms