Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBASH3AP57075 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBASH3AP57075 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms