Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK1P57059 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK1P57059 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK1P57059 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK1P57059 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIK1P57059 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms