Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1EP49674 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms