Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTBP49356 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTBP49356 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNTBP49356 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms