Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRXP46100 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRXP46100 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRXP46100 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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