Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OTX2P32243 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
OTX2P32243 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
OTX2P32243 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OTX2P32243 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OTX2P32243 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms