Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA7P31268 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA7P31268 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA7P31268 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA7P31268 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA7P31268 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA7P31268 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms