Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD40LGP29965 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms