Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E1P29083 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms