Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms