Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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