Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GNB3P16520 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB3P16520 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB3P16520 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB3P16520 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB3P16520 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB3P16520 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB3P16520 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB3P16520 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNB3P16520 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNB3P16520 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms