Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM27P14373 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms