Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-EP13747 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-EP13747 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms