Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHGAP10645 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHGAP10645 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHGAP10645 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHGAP10645 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHGAP10645 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms