Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD2P0DJD1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD2P0DJD1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms