Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN2P0C2S0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms