Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLK3P07288 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLK3P07288 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLK3P07288 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms