Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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