Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYF2O95926 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYF2O95926 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYF2O95926 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYF2O95926 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms