Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GABARAPO95166 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms