Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms