Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8AO60658 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms