Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN3BO60391 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms