Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms