Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCA5O60264 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms