Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA2O43921 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA2O43921 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms