Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP3O43295 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP3O43295 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms