Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KPNA3O00505 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms