Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIP1O00291 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIP1O00291 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIP1O00291 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIP1O00291 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIP1O00291 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIP1O00291 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIP1O00291 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIP1O00291 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIP1O00291 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIP1O00291 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIP1O00291 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIP1O00291 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms