Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
B4DXG7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
B4DXG7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
B4DXG7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms