Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOBPA7XYQ1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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