Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRRM4A7MD48 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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