Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms