Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWA8A3KMH1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms