Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2U4

Elf4, ETS-related transcription factor Elf-4, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf4Q9Z2U4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Elf4Q9Z2U4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Elf4Q9Z2U4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Elf4Q9Z2U4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Elf4Q9Z2U4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Elf4Q9Z2U4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Elf4Q9Z2U4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elf4Q9Z2U4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Elf4Q9Z2U4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Elf4Q9Z2U4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Elf4Q9Z2U4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Elf4Q9Z2U4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elf4Q9Z2U4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Elf4Q9Z2U4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elf4Q9Z2U4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elf4Q9Z2U4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elf4Q9Z2U4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elf4Q9Z2U4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elf4Q9Z2U4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms